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Proteome Intruments

Spectromètres de masse :

  • Orbitrap Fusion Lumos
    U3000-RSLC + Orbitrap Fusion Lumos (Thermo Scientific).
    Opérationnel depuis 2017.
     
  • AP-SMALDI5 AF Q-Exactive
    Source AP-MALDI (TransMIT) + Q-Exactive (Thermo Scientific).
    Opérationnel depuis 2013 (Q-Exactive) et depuis 2019 (Source MALDI).
     
  • LTQ Orbitrap XL ETD
    U3000 (Dionex)/Automate HDX (LEAP) + LTQ Orbitrap XL ETD (Thermo Scientific).
    Opérationnel depuis 2009.
     
  • Q-TRAP 5500
    Nexera XR (Shimadzu) + QTRAP 5500 System (AB Sciex).
    Opérationnel depuis 2009
     
  • MALDI-TOF-TOF
    Ultraflex III TOF-TOF (Bruker Daltonics) + Détecteur Haute Masse HM4 (CovalX).
    Opérationnel depuis 2008.
  • Q-TOF Premier
    U3000-RSLC (Thermo Scientific) + Q-TOF premier (Waters Micromass).
    Opérationnel depuis 2006.
  • Q-TOF Micro
    CapLC + Q-TOF micro (Waters Micromass).
    Opérationnel depuis 2005

 

Bioinformatique : 

  • Plateformes bioinformatiques : Proteome Discoverer 2.4 (Thermo Scientific).
  • Logiciels d'identification : Sequest HT (Thermo Scientific), MS Amanda (Thermo Scientific), Mascot 2.5 (Matrix Science), Peaks (Bioinformatics Solutions Inc), Prosight PD (Thermo Scientific).
  • Logiciels de quantification : Progenesis QI 2.0 (Nonlinear Dynamics), Proteome Discoverer 2.4 (Thermo Scientific).
  • Logiciels de caractérisation : Byonic 2.0 (Protein Metrics).
  • Logiciels d'imagerie : FlexImaging 4.0 (Bruker Daltonics) et SCiLS.

 

Serveurs et stockage : 

  • Archivage des données : 80To RAID 5.
  • Serveurs de calcul.
  • Hébergement dans salle serveur sous surveillance environnementale.

 

Biochimie des protéines : 

  • Electrophorèse Monodimensionnelle.
  • Systèmes d’IsoElectroFocalisation : OffGel (Agilent), Rotofor (Biorad).
  • Electrophorèse Bidimensionnelle Gels 24 cm : 
    • 1ère dimension   IPG Phor (Amersham Biosciences), Protean IEF Cell (BioRad)
    • 2ème dimension  Ettan Dalt Six ou twelve (Amersham Biosciences), Protean II Multicell (BioRad)
  • Electrophorèse Bidimensionnelle Gels 6 cm :
    • 1ère dimension   IPG Runner (Invitrogen)
    • 2ème dimension  Sure Lock (Invitrogen)
  • Analyse d'images : Scanner à fluorescence Pharos FX™ Plus avec external laser molecular imager FX (BioRad), ImageMaster™ 2D Platinum v5.0 (Amersham Biosciences), Quantity One 4.6.2 (BioRad), PDQuest 8.0.1 (BioRad), Progenesis SameSpots V2.0 (Non Linear Dynamics).
  • Spot cutter : EXQuest (BioRad).